جارٍ تحميل البيانات الجينومية…
دراسة تكاملية تجمع بين تسلسل الـ RNA وتسلسل الجينوم الكامل لسلالتَين محلّيتَين تونسيّتَين — شيلي ومحمودي — تكشف بصمات النسخ والجينوم لتكيّفهما مع البيئة المحلّية.
كيف تتكيَّف سلالة محلية يبلغ عمرها عشرة آلاف سنة مع بيئتها؟ قارنّا صنفَين متباعدَين من القمح الصلب التونسي عبر الأنسجة والظروف.
شيلي (شمال ووسط تونس الرطب) ومحمودي (جنوب تونس وداخلها شبه القاحل إلى القاحل، كما يُزرع في عدّة جهات أخرى) سلالتان محلّيتان متمايزتان شكلياً من T. turgidum، لا يزال يحفظهما عددٌ محدودٌ من الفلّاحين التقليديين.
حدَّد تسلسل الـ RNA في نسيجَي الجذر والورقة آلافَ الجينات ذات التعبير التفاضلي، وكشف أن مسارات الاستجابة للإجهاد منشَّطة تأسيسياً لدى محمودي حتى في الظروف المضبوطة.
كشف تسلسل الجينوم الكامل عن 46 نافذة FST شاذة دالّة إحصائياً (10 ك.ق) عبر اختبار التبديل، تُحدِّد مناطق خاضعة لانتقاء تباعدي تتمركز على الكروموسومات 1A و 2A و 5A و 6B و 1B و 2B.
أسفر التقاطع المرجعي للجينات التفاضلية مع QTL الإجهاد المنشورة عن أكثر من 160 جيناً مرشَّحاً مُتحقَّقاً منه، تُمثِّل أهدافاً واعدةً للانتقاء بمساعدة الواسمات الجزيئية في برامج تربية قمح حوض المتوسط.
صنفان قديمان، استراتيجيّتان للبقاء. هذا ما رمَّزته عشرة آلاف سنة من الانتقاء في كلٍّ من الجينومين، وما يُقدِّمانه لمستقبل تربية القمح.
"نشأتُ حيث تُلطِّفُ نسائمُ البحرِ الحرَّ وتأتي الأمطارُ الموسميةُ في مواعيدها. استراتيجيّتي الكفاءةُ لا التسلُّح. أستثمرُ في النمو، وفي مكاسبِ التركيب الضوئي، وفي تخفيف الحِملِ التأكسدي. أحملُ آلياتِ إزالةِ جذورِ الأكسجين النشطة، ودوراناً بروتينياً دقيقاً. لم أُبنَ للأزمات — بل بُنيتُ لأزدهرَ حين تسمحُ الظروف. في عالمٍ متغيِّر، أنا ما زرعَتْه الزراعة: إنتاجيةٌ مُحسَّنة."
"تَشكَّلتُ في أقسى تُرَب الجنوب التونسي، حيث المطرُ مُجرَّدُ شائعةٍ والشمسُ لا تَرحم. تعلَّمت جذوري أن تقتنصَ كلَّ قطرة، وتعلَّمت أوراقي أن تتمسَّك. لا أنتظرُ الإجهادَ لأستجيب — فأنا على أُهبة الاستعداد دائماً. حُرّاسُ NLR لديّ يقظون أبداً، وديهيدريناتي لا تنامُ نوماً عميقاً، ومنظومةُ اليوبيكويتين فيَّ تُقلِّمُ البروتينات المتضرِّرة في صمتٍ قبل أن تتراكم. أنا مُكلِفٌ في تشغيلي، لكنِّي لا أنكسر."
تصفَّح وفلتِر جميع الجينات ذات التعبير التفاضلي. انقر على رؤوس الأعمدة للترتيب. ابحث بمعرّف الجين أو اسم المنتج البروتيني.
| معرّف الجين ↕ | المنتج البروتيني ↕ | الفئة ↕ | المقارنة ↕ | الاتجاه ↕ | log₂FC ↕ | قيمة p المعدّلة ↕ |
|---|
جينوميات سكّانية موزّعة على الكروموسومات. انقر على شريط أيِّ كروموسوم لاستعراض تفاصيله. تُشير الكروموسومات ذات شواذ FST إلى مناطق خاضعة لانتقاء تباعدي.
إثراء المسارات البيولوجية عبر 16 فئة وظيفية مُنتقاة يدوياً اعتماداً على وصوفات AHRD. بدِّل الاتجاه لاستكشاف ما تُنشِّطه كلُّ سلالة.
جينات تفاضلية مُتقاطعة مرجعياً مع QTL الإجهاد المنشورة في القمح الصلب وقمح الخبز. تُمثِّل هذه الجينات أولوية للانتقاء بمساعدة الواسمات الجزيئية.